1997 год – Первые награды
Свои первые награды «Кайнур», состав которого был сформирован из местных игроков, завоевал в 1997 году. Это были серебряные награды розыгрыша Кубка Казахстана. Спустя два года, одолев в финале знаменитый карагандинский «Локомотив», алматинский клуб впервые становится обладателем Кубка страны. Сезон 1999/2000 «Кайнур» завершил на второй строчке чемпионата Казахстана, тем самым, завоевав первое «серебро».